บริษัทที่ได้รับใบอนุญาตเปิดดำเนินการแล้ว จะยังสามารถแก้ไขโครงการเพื่อแก้ไขชนิดผลิตภัณฑ์ เพิ่มกำลังผลิต หรือแก้ไขกรรมวิธีการผลิต ได้หรือไม่

โครงการที่ได้รับใบอนุญาตเปิดดำเนินการแล้ว จะแก้ไขโครงการได้เฉพาะกรณีที่ไม่มีการลงทุนเพิ่มเติมเท่านั้น เช่น
- เพิ่มกำลังผลิต โดยการเพิ่มเวลาทำงาน
- เพิ่มชนิดผลิตภัณฑ์ ภายใต้กำลังผลิตเดิม โดยไม่ต้องลงทุนเครื่องจักรเพิ่ม เป็นต้น

ยกเว้นอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์ เครื่องไฟฟ้า และชิ้นส่วน ตามประกาศ กกท ที่ 6/2549  จะสามารถนำเครื่องจักรเข้ามาปรับปรุงโครงการ หรือเพิ่มกำลังผลิตได้ แม้จะเปิดดำเนินการเต็มโครงการแล้วก็ตาม